正常的健康妇女，阴道由于解剖组织的特点对病原的侵入有天然的防御功能。如阴道口的闭合，阴道前后壁紧贴，阴道上皮细胞在雌激素的影响下增生，和表皮细胞角化，阴道酸碱度保持在ph4-5，使适应碱性的病原如厌氧菌的繁殖受到抑制等。
当阴道的自然防御功能受到破坏时，病原易于侵入，引发阴道炎。在妊娠期，孕妇血中雌激素的水平随孕周的增加而逐渐升高，在孕晚期达到高峰。雌激素使阴道上皮内糖原增加，酸度增高，利于念珠菌生长繁殖，从而使得寄生菌变成致病菌;另一方面，由于孕期免疫功能下降，对疾病的防御能力减弱，因此，孕期阴道炎的发生率比孕前会有所增加。