正常情况下，阴道内的菌群比较平衡，酸碱度比较均衡（ph值大概在3.8-4.5之间）。这种适宜精子暂时存留、通过的环境，是非常重要的，一旦这种环境被破坏，就容易发生不孕。
如果患了细菌性阴道炎(bacterial vaginosis)，阴道的ph值会超过4.5，阴道内环境酸碱度的改变会使精子的活动力受到抑制。另外，致病菌会吞噬精子，且患细菌性阴道炎时，阴道内分泌物大量增多，分泌物中含有大量的白细胞，这些都会妨碍精子的成活，使精子数量减少。精子本来数量少、活动度差者，就很有可能引起不孕。另外，一旦炎症上行，感染到宫腔，造成输卵管炎、盆腔炎等，也会造成不孕。当然，如果积极治疗，是可以再次怀孕的。